1. 山本喜久、上田正仁
量子光学と新技術 (Ｉ): 量子力学の基礎（Ｉ）不確定性原理
電子情報通信学会誌 vol. 72, pp.669-675 (1989)

2. 山本喜久、上田正仁
量子光学と新技術(II): スクイズド状態と光子対
電子情報通信学会誌 vol. 72, pp.807-815 (1989)

3. 山本喜久、上田正仁
量子光学と新技術 (III): 量子非破壊測定
電子情報通信学会誌 vol. 72, pp.915-921 (1989)

4. 山本喜久、上田正仁
量子光学と新技術 (IV): 共振器量子力学
電子情報通信学会誌 vol. 72, pp.1014-1020 (1989)

5. 山本喜久、上田正仁
量子光学と新技術 (V): 微小トンネル接合による電流の量子化
電子情報通信学会誌 vol. 72, pp.1177-1184 (1989)

6. 山本喜久、上田正仁
量子光学と新技術 (VI): 量子力学の基礎（II）重ね合わせの原理と観測問題
電子情報通信学会誌 vol. 72, pp.1430-1436 (1989)

7. 山本喜久、上田正仁
量子光学と新技術 (VII): 量子力学と情報
電子情報通信学会誌 vol. 73, pp.63-68 (1990)

8. 山本喜久、 上田正仁
量子光学と新技術 (VIII): 応用・結論
電子情報通信学会誌 vol. 73, pp.161-166 (1990)

9. 上田正仁
トンネル電流の量子化
パリテイ vol. 5, pp.22-28 (1990)

10. 上田正仁
光子数の連続測定：情報と波束の収縮
物性研究 vol. 58, pp.235-255 (1992）

11. 上田正仁
微小接合におけるトンネル電流の量子化
日本物理学会誌 vol. 47, pp.717-720 (1992)

12. 上田正仁
微小トンネル接合の物理とその応用 ｢単一電子エレクトロニクスへの展望｣
応用物理 vol. 62, No.9, pp.889-897 (1993)

13. 上田正仁
電子一つでデバイスを操る
パリテイ vol. 8, pp.48-53 (1993)

14. 上田正仁
微小トンネル接合の物理と電磁場環境の影響
固体物理 vol. 28, pp.783-794 (1993)

15. 小川哲生、上田正仁、井元信之
番犬はシュレーディンガーの猫を生むか？: 光子場の波束の収縮
日本物理学会誌 vol. 48, pp.781-788 (1993)

16. 上田正仁
メゾスコピック系におけるトンネル現象；帯電効果・非平衡電流雑音・トンネル時間
日本物理学会誌 vol. 49, pp.751-757 (1994)

17. 上田正仁
レーザー冷却された中性原子気体のBose-Einstein凝縮
日本物理学会誌 vol. 53, pp.663-672 (1998)

18. 上田正仁
レーザー冷却されたボース・アインシュタイン凝縮が開く新しい世界
特集号 打ち寄せる原子のさざなみ「レーザー冷却とボース・アインシュタイン凝縮」
パリテイ vol. 14, pp.18-27 (1999)

19. 斎藤弘樹、上田正仁
レーザー冷却された中性原子気体のボース・アインシュタイン凝縮
固体物理 vol. 36, pp.1-9 (2001)

20. 青木秀夫、上田正仁、金子邦彦、谷森 達、田崎晴明、米谷民明、細谷暁夫
座談会「物理学の明日」
日本物理学会誌 vol. 56, pp.648-659 (2001)

21. 上田正仁
ボース・アインシュタイン凝縮と巨視的量子現象
数理科学 vol. 473（11月号）, pp.42-47 (2002)

22. 斎藤弘樹、上田正仁
引力相互作用するボース・アインシュタイン凝縮体の動的振舞い
日本物理学会誌 vol. 55, pp.607-610 (2003)

23. 上田正仁
マクロな量子の世界への誘い
数理科学 vol. 496（10月号）, pp.5-10 (2004)

24. 寺嶋容明、上田正仁
アインシュタイン・ポドルスキー・ローゼン相関に関する相対論的効果
日本物理学会誌 vol. 61, No.6, pp.420-423 (2006)

25. 上田正仁
特集 物理を変える 光科学の挑戦「量子物理学の新時代の幕開け」（コラム）
科学（岩波書店）vol.76, No.10 (2006)

26. 青木秀夫、上田正仁、福山 寛
特集 新しい物質化学の創成 超伝導100年
座談会「ブレイクスルーに向けて何が進んでいるか」
科学（岩波書店）vol.78, No.2, pp.220～229 (2008)

27. 沙川貴大、上田正仁
Maxellのデーモンと情報熱力学
数理科学 No. 545（11月号）, pp.18-23 (2008)

28. 上田正仁、羽済昌史、前川展裕、横山順一
座談会「三博士ノーベル物理学賞受賞の報を受けて」
日本物理学会誌 vol. 64, No.2, pp. 97～105 (2009)

29. 斎藤弘樹、川口由紀、上田正仁
磁性超流動体におけるスーパーノヴァ
科学（岩波書店）vol. 79, No.2, pp.139～141 (2009)

30. 川口由紀、斎藤弘樹、上田正仁
磁気双極子相互作用するボース・アインシュタイン凝縮体
日本物理学会誌 vol. 64, No.8, pp.623～627 (2009)

31. 小林未知数、川口由紀、新田宗土、上田正仁
スピノル・ボース・アインシュタイン凝縮で実現する非可換量子渦とその衝突ダイナミクス
日本物理学会誌 vol. 65, No.8, pp.625～628 (2010)

32. 上田正仁
ボース・アインシュタイン凝縮（現代物理学の世界 トップ研究者からのメッセージ）
二宮正夫（編集）講談社基礎物理学シリーズ,  単行本（共著）pp. 51-58 (2010)

33. 沙川貴大、上田正仁
微小非平衡系における情報熱力学
日本物理学会誌 vol. 66, No. 11, pp.828～831 (2011)

34. 堀越宗一、向山　敬、上田正仁
-最近の研究から- ユニタリー極限におけるフェルミ原子気体の普遍的熱力学
日本物理学会誌 vol. 67, No. 4, pp.257～261 (2012)

35. 上田正仁
冷却原子気体の最近の話題
応用物理学会誌 vol.82 No.9 pp.744～753 (2013)

36. 渡辺優、上田正仁
量子推定理論による不確定性関係の定式化
日本物理学会誌 vol.71 No.6 pp.372～376(2016)

37. 上田正仁
まずは「違和感」を自分の言葉で書き出すクセを あきらめない人間力で、問題を見つけ、解く力の鍛え方
人材教育 vol.29 No.10 pp.22～25（2017）

38. D. S. ワイス，M. シャフマン　上田正仁訳
中性原子の個別操作による量子計算
パリティ Vol.33 No.3 pp.11～19(2018)

39.　上田正仁
量子制御技術の進展
日本物理学会誌　Vol.74 NO.6 pp.368～369(2019)